Wet系バイオインフォマティシャンの災難

機械に弱いバイオ研究者に降りかかる災難を綴っていきます。 Twitter: @1wantphd

MACS2のインストール

 坊農先生のブログ

MACS2のインストール | ぼうのブログ(Backup)

に従い、MACS2のインストールを試みましたが、

Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1

とエラーが出てしまいインストールできず…

 

pipとsetuptoolsをアップグレードすることで解決できるとの記事を見つけ、

試してはみたがやはりうまくいかず…

ja.stackoverflow.com

 

python環境の問題かと考えて色々試した挙げ句、

condaでインストールできることが判明したため目的は達成できました。

$ conda install -c bioconda macs2

MACS2はpython2.7を要求するので仮想環境の設定をお忘れなく。

$ source activate py27

 

pipでインストールできなかった原因だけが気がかりです。