Wet系バイオインフォマティシャンの災難

機械に弱いバイオ研究者に降りかかる災難を綴っていきます。 Twitter: @1wantphd

2019-03-01から1ヶ月間の記事一覧

複数ファイルの一括削除

ターミナルのコマンドは主にカレントディレクトリを参照するため、 サブディレクトリを含めたファイルの削除などは以下のコマンドが便利です。 find . -type f -name "*.txt"|xargs rm findでtxtの拡張子を持つファイルを検索し、 見つけたファイルを引数と…

Homerのインストールとエラー

Bioinformaticsにおける解析ツール、Homerをダウンロードします。 Xcodeをインストールしていないと後述のようなエラーが出ますのでお気をつけて。 まず、App storeからXcodeをインストールした後、 ターミナルからコマンドラインツールを入れます。 $ xcode…

rsyncによるバックアップフォルダの同期

rsyncはデータの移送元と移送先を比較して、移送先にないデータだけをコピーするコマンドです。 移送先にあるデータでも移送元に更新日時の新しいバージョンがあればそれもコピーされます。 メインコンピュータと外部HDDのバックアップのデータを同期させる…

MACS2のインストール

坊農先生のブログ MACS2のインストール | ぼうのブログ(Backup) に従い、MACS2のインストールを試みましたが、 Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 とエラーが出てしまいインストールできず… pipとsetuptoolsをアップグレードする…